Доктор Юнг, загадочный учёный, специализирующийся на покемонах, разработал новую систему «Мираж», которая использует компьютерные данные для воскрешения давно исчезнувших покемонов, таких как Кабутопс и Армальдо. По приглашению доктора Юнга Профессор Уцуги Оук, Эш и его друзья прибывают в особняк Мираж, чтобы понаблюдать за демонстрацией возможностей машины. Но в разгар battle между покемоном-Миражом доктора Юнга и Эшем система внезапно выходит из-под контроля: Мираж-Аэродактиль стремительно налетает и похищает самого доктора Юнга. Появляется человек, называющий себя «Повелителем Миражей», и объявляет всем присутствующим, что система «Мираж» способна создавать покемонов, у которых абсолютно нет слабых мест. Эшу, Мисти и Профессору Оуку предстоит сразиться с безумцем и попытаться спастись живыми.