Второй сезон начинается с того, что Махоро и Сугуру пытаются ужиться под одной крышей. Бывшая боевая андроид-горничная старается вести себя как обычная женщина, но её прошлое не отпускает. В доме появляется новая девушка-андроид, которая настойчиво ищет внимания Махоро и всячески путается под ногами. Отношения с одноклассниками Сугуру тоже не стоят на месте, и прежние шутки оборачиваются чем-то более серьёзным.

Действие разворачивается в том же прибрежном городке, где живут герои. Махоро продолжает выполнять обязанности по дому и следить за Сугуру, но каждый прожитый день приближает её к моменту полной разрядки. Счётчик дней тикает, и это ощущается в каждой сцене — от бытовых стычек до редких спокойных вечеров. Новая андроид делает ситуацию ещё менее стабильной, а попытки Махоро притворяться, что всё в порядке, становятся всё менее убедительными.

Студия Gainax и Shaft сохраняют прежний баланс: комедийные эпизоды перемежаются с драматическими паузами. Этти-сцены никуда не делись, но теперь за ними чаще проглядывает грусть. Сугуру взрослеет, и его отношение к Махоро меняется, но он по-прежнему не знает, как ей помочь.