Год назад «Трай Файтерс» вырвали победу в национальном первенстве, и теперь их ждёт новое испытание. Корпорация «Ядзима Трейдинг» приглашает команду на уединённый остров для тестирования экспериментальной боевой платформы. Сэкай и Фумина прибывают на место и тут же сталкиваются с неожиданным сюрпризом: их соперники, включая Гянко, Шию и Минато, тоже получили приглашение. Юма отказывается от поездки, чтобы помочь Мирай с фотосессией, но судьба распоряжается иначе — он оказывается на том же острове, воссоединяясь с товарищами в самый разгар событий.

Пока файтеры осматриваются, в лаборатории Нильса происходит сбой: новые частицы Плавски кристаллизуются в чудовищный артефакт, который мгновенно выводит из строя все Ганпла на острове. Механизмы начинают жить своей жизнью, угрожая полным хаосом. Теперь героям придётся забыть о соперничестве и объединить усилия, чтобы сдержать бесконтрольную мощь кристалла. Если они не успеют, волна разрушения захлестнёт глобальную систему Ганпла Баттл, превратив игру в катастрофу мирового масштаба. Ставки высоки, время уходит, и только совместная работа всех мастеров боя сможет предотвратить неминуемый коллапс.